Program Studi Pendidikan Profesi Apoteker STFI terus berinovasi dan berkembang dalam menghasilkan lulusan yang memiliki kompetensi apoteker sesuai dengan persyaratan nasional Ikatan Apoteker Indonesia (IAI) dan The International-Pharmaceutical Federation (FIP). Pendidikan ditempuh selama 1 tahun dengan menyelesaikan 40 SKS, PKPA di 5 bidang, lulus dalam UKMPPAI-CBT dan UKMPPAI-OSCE.